如何将序列或对齐导出为格式化文本？[更新为Prime 2019.2]

In Geneious Prime 2019.1 onwards the Text View tab is able to display your sequences or alignments in customisable plain text which can then be exported or copied, or in a rich (formatted) text format which can be copied and pasted into a text editor or Microsoft Word document.  

在Geneious Prime 2019.2。中对此工具进行了进一步的改进。如果您使用的是Geneious Prime 2019.1，请更新至版本2019.2。

要使用“自定义文本视图”功能，请选择一个序列或一个比对，然后切换到“ 文本视图”窗格。

单序列

选择一个或多个相同类型（DNA或蛋白质）的序列和/或序列表后，切换到“ 文本视图”窗格，然后使用“ 格式：”下拉菜单选择在GenBank中 ，“ 自定义”还是“原始”原始视图中查看（ Don重新格式化 ）。

选择“ 自定义”，然后单击“ 显示选项”按钮以显示“ 格式选项”对话框窗口，然后选择以纯文本或富文本格式显示。 

您还可以选择显示序列名称和描述，以及碱基是大写（默认）还是小写。  要显示互补反向链，请选中显示反向互补 。

您可以选择显示特定框架上完整序列的翻译 ，也可以选择跨多个范围显示翻译 。  请注意，每个CDS必须朝前。If the selected sequence has CDS annotations, and you select these Annotations in the Sequence view or Annotations table, then these regions will be automatically available to display as "Specified regions"†.

Under Layout, you can set Bases per line, set numbering/numbering position, margin width and ruler settings.You can break the sequence into blocks by checking and defining the option Separate bases:（如果启用“分离基准”，则无法显示标尺）。

如果选择RTF格式，则还可以使用“ 序列颜色”选项突出显示序列中的一个或多个区域或使用颜色对齐。

对齐

Select a single alignment file, switch to the Text View pane, and use the Format: dropdown menu to switch between the Custom view or the original plain view (Don't reformat).

选择“ 自定义”，然后使用“ 显示选项”按钮显示“ 格式选项”对话框窗口，然后选择以纯文本或富文本格式显示。  

“ 突出显示基础”部分使您可以显示与共识的分歧，约定，异同。

您也可以按照与单个序列相同的方式设置布局和序列颜色 。 

导出文字

Use the Copy full sequence button to copy the displayed text (with color formatting) to the clipboard, or use the Save as *.txt button to export the displayed text (without formatting) to a text file.

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† If your CDS has more than one exon (a multi-interval annotation) and your exons start or end after the first or second codon positions then you will need to manually adjust the start and end coordinates for each exon to set the break to fall after the third codon position to ensure correct translation is displayed.