NCBI服务过渡到API密钥

Geneious Prime和Geneious的早期版本使用NCBI“ E-Utilities API”与NCBI Blast和搜索服务进行接口。

2018年12月1日，NCBI实施了一个使用个性化“ API密钥”进行搜索/Blasting的新系统。有关更多信息，请参见以下NCBI公告 。

Geneious R11.1和Geneious Prime允许您使用自己的NCBI API密钥。请参阅以下有关如何获取和使用API密钥的说明。

以前，Geneious对NCBI E-Utilities API发出的请求的频率受到监控，并基于IP地址进行限制。 

具有API密钥的用户将根据其唯一密钥受到监视和限制，并且每秒最多可允许10次向NCBI的请求。

NCBI仍允许没有API密钥的Geneious用户每秒最多向NCBI发出3个请求。  Geneious和Geneious Prime会遵守这一限制，只有一个例外。如果要搜索NCBI，请确保展开NCBI搜索列表并选择并仅搜索单个数据库。  不要选择顶部的NCBI图标，因为Geneious会同时搜索所有9个数据库，这将超出请求限制并导致搜索失败。

请注意，如果您在与其他Geneious用户共享的机构网络中，则可能需要API密钥。  在机构网络上，所有通用用户搜索请求似乎都来自相同的IP地址，因此NCBI搜索和/或Blast搜索可能会超出每秒3个请求的限制，并且所有请求都可能被NCBI拒绝。

 

在Geneious R11.0.5和更早版本中，“请求限制”错误将包括：搜索失败消息：服务器返回HTTP响应代码：429 for URL: 

 

在Geneious R11.1.3和更高版本中，“请求限制”错误将报告更多信息：

 

 

对于Geneious R7和更早版本的用户

您不会看到此错误，因为NCBI服务在Geneious R7和更早版本中不再起作用-请参见NCBI向HTTPS的过渡 。您应该购买Geneious Prime的最新版本的升级才能访问NCBI。

 

对于Geneious R8.1.9至R10.2.6的用户

1确保您搜索单个NCBI数据库。

2使用VPN服务，以便您的搜索请求不会来自您的机构IP地址。

3。当您在机构网络上使用Geneious的频率不太高时，请尽早执行搜索。

4。在您的机构网络之外使用Geneious。

5，购买Geneious Prime 2019或更高版本的升级并注册您自己的API密钥（请参阅下文）。

 

Using an API key with Geneious R11 and Geneious Prime 2019

You’ll see a new “API Key Management” area.Click the “Create an API Key” button. 

 

 

复制新的37个字符的API密钥，运行Geneious R11.1或Geneious Prime，转到菜单工具->首选项-> NCBI选项卡，然后将API密钥粘贴到提供的字段中。