错误：您的操作系统不允许Geneious同时打开足够的文件来执行操作

基于Unix的操作系统（包括Apple OSX和Linux）限制了一次可以打开多少个文件。这不仅包括可见文件，还包括Geneious，操作系统和计算机上运行的任何其他软件在后台使用的所有各种临时隐藏文件。 

当您使用大量引用序列运行程序集时，可能会遇到此错误。  例如，当针对大量参考转录本组装RNAseq NGS数据时，可能会发生此错误，因为Geneious每个参考序列需要几个打开的文件。 

默认情况下，Mac OS X可以打开的最大文件数设置为12,288，给定进程可以打开的最大文件数为10,240。 

For Linux OS’s the maximum number of files may vary depending on the “flavour” of Linux.

有两种解决方案可以解决此错误：

1  减少编号参考序列

您可以通过将参考序列列表连接成一个序列来减少Geneious所需的打开文件数。  这可以通过选择单个列表并转到Geneious菜单工具->串联序列和比对来完成 。  如果您的参考文献带有注释，则组装后，您将可以使用覆盖图和注释信息来识别RNAseq读物所针对的转录本。

我们建议您使用该选项来添加多晶硅隔层。  这将确保汇编程序不会在相邻的转录本上错误地映射读取，并且，这也应有助于转录后添加的映射。

请注意，当用于10,000个或更多序列时，Geneious R8和更早版本中的串联工具性能较差。  此问题已在Geneious R9及更高版本中修复。

2  更改系统默认设置

You can alter the default “open file” limits for your operating system.  我们提供以下链接以及有关操作方法的说明，但使用后果自负！  

OSX  http://krypted.com/mac-os-x/maximum-files-in-mac-os-x/

Linux  http://www.cyberciti.biz/faq/linux-increase-the-maximum-number-of-open-files/