从 TSV/CSV 文件导入引物组的快速指南

引物集,例如由 Artic 网络提供的用于 SARS-Cov-2 平铺扩增子测序的引物集,可以轻松地从制表符或逗号分隔的文件导入 Geneious。 

首先,在您的数据库中创建一个新文件夹,用于放置引物。  我们建议为每组引物使用单独的文件夹。  然后将包含引物的文件拖放到 Geneious 窗口,并在提示处选择格式(TSV 或 CSV)。  

导入csv.png

在下一个窗口中,确保将文件中的每一列分配给 Geneious 中的正确字段,即将包含引物名称的列分配给 Name 字段,并且序列在 Sequence 字段中等。选择 Primer 作为导入类型,并选择“确定特征”以确保将 Tm 值添加到序列中。  

Importcsv2.png

Then click OK to import the sequences. 

Sars-Cov-2 分析的引物来源

北极网:

入门方案的 Github 存储库可从https://github.com/artic-network/artic-ncov2019/tree/master/primer_schemes/nCoV-2019 获得

选择您正在使用的版本的文件夹(例如 V1、V2 或 V3),该文件夹中有一个 .tsv 文件。   

V3_download.png

选择此文件以打开它,并将内容复制到基本文本编辑器(不要使用 Word)。  使用 .tsv 后缀保存文件,然后将其拖放到 Geneious 中以如上所述导入它。  

CDC 多重和单重 PCR 引物

Sars-Cov-2 测序协议的 Github 存储库可在https://github.com/CDCgov/SARS-CoV-2_Sequencing/tree/master/protocols/CDC-Comprehensive

选择 Multiplex_PCR 或 Singleplex_PCR 文件夹,该文件夹内是一个包含引物的 .tsv 文件。   

CDC_download.png

选择此文件以打开它,并将内容复制到基本文本编辑器(不要使用 Word)。  使用 .tsv 后缀保存文件,然后将其拖放到 Geneious 中以如上所述导入它。  

 

译者水平有限,译文可能有瑕疵,以英文为准!
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