Geneious vs GenBank：GenBank格式的Geneious Prime文件的命名和导出

在Geneious Prime中，DNA和蛋白质序列上的功能元件被记录并描述为注释。注释与GenBank功能等效。 

注释通常具有关联的属性信息（在GenBank中称为“限定符”）和时间间隔坐标（在GenBank中称为位置描述符）。参见表1。

表格1。命名法：Geneious vs GenBank

表2列出了规定用于GenBank文件的标准功能名称，有关完整摘要，请参见http://www.insdc.org/documents/feature_table.html#3.3 ，该摘要还描述了每种功能类型的关联限定符。

表2：GenBank文件中使用的功能的标准名称。

† As of 15 Dec 2014, regulatory replaces enhancer, promoter, CAAT_signal, TATA_signal, -35_signal, -10_signal, RBS, GC_signal, polyA_signal, attenuator, terminator, misc_signal.如果存在，Geneious将正确处理这些已弃用的功能类型。

以严格的GenBank格式从Geneious导出

严格的GenBank格式要求轨迹名称的最大长度为16个字符，且没有内部空格，并且仅包括标准功能（如上表2所示）。

Geneious可以处理带有带有非标准特征名称的注释（特征）的序列，并且能够正确导入包含非标准特征名称的GenBank文件。

但是，Geneious外部的软件可能无法处理非标准功能名称或非标准轨迹名称。  To export your file with Features in strict GenBank format, select the file/s to be exported, and go menu File - Export - Selected documents. 

在“导出设置”窗口中，选中将注释转换为严格的GenBank格式的选项。  所有不使用标准要素名称的注释都将转换为要素类型misc_feature 。 

为了确保最大的兼容性，请取消选中允许[Locus]名称超过16个字符的选项，然后选中“ 用下划线替换[locus]名称中的空格 ”选项。

如果您的Geneious文件包含通过“序列”视图的“ 信息”选项卡添加的元数据，则可以选中“将元数据包括在GenBank文件的注释”部分中的选项，以将元数据导出到GenBank文件的“ COMMENT”部分中。