我在哪里可以获得嵌合体过滤的参考数据库?

要使用Geneious R10中的嵌合体去除工具,您必须提供自己的参考数据库。  这应该是被认为没有嵌合体的高质量序列的序列表,并包括可能在查询集中显示为亲本的序列。  It is recommended to use the largest possible database e.g. SILVA for 16S or UNITE for ITS.  

席尔瓦:SILVA provides comprehensive, quality checked and regularly updated datasets of aligned small (16S/18S, SSU) and large subunit (23S/28S, LSU) ribosomal RNA (rRNA) sequences for all three domains of life (BacteriaArchaea and Eukarya).  有关Silva数据库的信息和下载链接,请参见此处

Fungal ITS: UNITE:  目前,这是唯一推荐的真菌ITS序列嵌合体检测数据库。它包括全长ITS1和ITS2的数据集。  要下载,请转到UNITE资源页面 。  展开“ UCHIME / USEARCH / UTAX参考数据集”链接,然后转到“所有UCHIME参考数据集列表”部分,然后单击所需版本的“下载”链接。从zip存档中提取适当的FASTA文件,然后作为核苷酸序列导入Geneious。仅包括正向链。

译者水平有限,译文可能有瑕疵,以英文为准!
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