如何以csv格式导出BLAST结果

BLAST 搜索的结果可以显示为命中表或以查询为中心的比对。  要导出单个 Hit 表的结果(即单个 BLAST 搜索的结果),请选择要导出的文档表中的所有条目,然后选择File -> Export -> Selected Documents 。 

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选择将此文件保存为.csv格式,并为文件指定一个名称。这将打开一个菜单,允许您从表中选择要导出到此文件中的列。

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选择要导出的字段,然后选择“确定”以导出文件。

要在单个表中导出批处理 BLAST 的结果,您应该在设置 BLAST 搜索时,改为仅在结果下选择以查询为中心的对齐方式。  

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这将为每个查询返回一个比对,您将看到比对中的所有命中都有一个搜索命中注释,其中包含有关 BLAST 命中的详细信息,例如描述、E 值和身份百分比。   您可以使用 Annotations 表将所有查询的所有这些信息导出到单个 CSV 文件中。 

选择返回的所有比对,您将在序列查看器底部看到一个结果表。

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选择Types -> Show One -> Search Hit以仅在表格中显示您的 BLAST 搜索结果。按钮将允许您添加和删除列以显示诸如 % Pairwise Identity 和 E 值之类的值。  更改此表以反映您希望导出的详细信息后,您可以通过单击“导出表”按钮以 .csv 格式导出此表。  

 

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