插件包装错误

抱歉回复晚了，这意味着命令行工具返回非 0 退出代码。这有帮助吗？您可以尝试直接从命令行运行相同的命令，以查看是否将任何内容打印到标准错误中。

对于 9.0.1，我已将退出代码显示为显示的错误消息的一部分。

谢谢，理查德。它在命令行上使用以下命令运行良好：

usearch.exe -derep_prefix in.fa -fastaout 输出 -sizeout

我已将插件的命令行选项更改为以下内容：

-derep_prefix [inputFileNames] -fastaout 输出 -sizeout

所以这些应该类似地工作。在命令行上运行后 %errorlevel% 为 0，因此它在正常工作时会产生正确的退出代码。错误可能是由于文档类型吗？这些序列在一个列表中。我目前选择了“未对齐的序列（2+）”。

克里斯

该插件实际上对我来说工作正常。只是为了检查它不是导致问题的输入数据，您可以在示例文档的“Contig Assembly”文件夹中的“yghJ Ion Torrent read”序列列表上运行它吗？那个对我有用并返回 2,464 个序列。

我刚刚在“yghJ Ion Torrent 读取”上尝试了这个，我看到了相同的“操作失败”对话框。

我刚刚下载了 R9 测试版。This is now working well for me.

这很奇怪，但我很高兴你让它工作了。如果您需要更多帮助，请告诉我们。

如果您正在进行去复制，您还可以尝试 R9 中Sequence菜单下的Remove Duplicate Reads 功能。比较一下可能会很有趣。

我在 9.0.2 中再次看到这个问题。我使用相同的可执行文件，但使用标志来运行不同的算法。这次有一个信息量更大的错误代码：-1073741515（或 0xC0000135）。

我的意思是给你错误的全文：

“手术失败。错误是：

运行失败：C:\Users\cgaray\Geneious 9.0 Data\WrapperPluginDevelopment\usearch 前缀 derep\usearch.exe -derep_prefix input.fasta -fastaout output -sizeout，退出代码：-1073741515

usearch 前缀 derep 没有报告错误信息

原因：运行失败：C:\Users\cgaray\Geneious 9.0 Data\WrapperPluginDevelopment\usearch 前缀 derep\usearch.exe -derep_prefix input.fasta -fastaout output -sizeout，退出代码：-1073741515 com.biomatters.geneious.publicapi.plugin.DocumentOperationException at com.biomatters.iseek.plugin.wrapperplugins.WrapperOperation.a(WrapperOperation.java:443) at com.biomatters.iseek.plugin.wrapperplugins.WrapperOperation.b( .java:221) 在 com.biomatters.iseek.plugin.wrapperplugins.WrapperOperation.a(WrapperOperation.java:149) 在 com.biomatters.iseek.plugin.wrapperplugins.WrapperOperation.performOperation(WrapperOperation.java:125) 在 com。 biomatters.geneious.publicapi.plugin.DocumentOperation.performOperation(DocumentOperation.java:464) at com.biomatters.geneious.publicapi.plugin.DocumentOperation.performOperation(DocumentOperation.java:410) at com.biomatters.iseek.plugin.operations。 p.run(OperationManager.java:453) at com.biomatters.geneious.common.operations.ba(OperationsUtilities.java:139) at com.biomatters.geneious.common.operations.ba(OperationsUtilities.java:136) at com .biomatters.geneious.common.operations.a$cb(OperationsUtilities.java:115) 在 com.bioma tters.geneious.common.operations.a$ba(OperationsUtilities.java:136) at com.biomatters.iseek.plugin.operations.ea(OperationManager.java:447) at com.biomatters.iseek.plugin.operations.ua( OperationPerformer.java:98) 在 com.biomatters.iseek.plugin.operations.OperationAction.performAction(OperationAction.java:121) 在 com.biomatters.iseek.plugin.operations.OperationAction.access$000(OperationAction.java:29) 在com.biomatters.iseek.plugin.operations.a.run(OperationAction.java:84) 在 java.lang.Thread.run(Thread.java:745)"

啊，这看起来像是 userarch 的一个 DLL 问题，我可以解决这个问题（ http://www.drive5.com/usearch/manual/vcomp100.html ）。谢谢。