生长重叠群四肢的通用工作流程

你好

我不确定您的建议会比当前的 Iterate 函数更快或更好。

增加 Geneious Prime 映射器“迭代”设置应该“增长”您的程序集超出参考序列的范围，前提是存在超出参考范围的连续系列重叠的读取。

你尝试了多少次迭代？

尝试将迭代设置为更高的数字，比如 1000，看看是否有效。  Geneious 只会根据需要执行尽可能多的迭代。

如果程序集因高迭代值而变慢，请考虑使用菜单Sequence -> Error Correct and Normalize reading 来规范化（不要纠错）您的读数。  这可能会大大减少数据集的大小，并允许在高迭代设置下更快地进行组装。  一旦你产生了一个扩展的共识，你可以用完整的读取集来映射它以生成最终的共识。