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对齐后导入的GBK文件丢失了突变部分并剥离了间隙。

Hello, 

成对对齐(MAFFT,MUSCLE 不起作用)后,我将注释转移到其他序列。但是每当我试图将这个序列导入基因库文件时,所有的突变和缺口都会被剥离。因此,碱基对也减少并失去了序列的整体完整性。但是,如果我将这个文件保存为通用格式,那就没问题了。所以我的问题是如何让 GB 文件保持原样。 

感谢你的帮助。

KM Taufiqur Rahman

3 条评论

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请通过 Geneious 中的“联系我们”按钮向我们发送您的文件副本,以便我们查看格式。  请注意,Genbank 格式不是比对格式,因此它只会导出比对中的单个序列,而不是比对期间引入的间隙。  如果您想要包含对齐序列的文件,最好以 fasta 格式导出。 

希拉里·米勒(Hilary Miller) 0 票
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感谢您的信息。好的,我会发送文件。能否请您协助解决另一个问题,即我无法导入我的 contig 文件,该文件大小为 5GB,但可以轻松导入小文件。谢谢

KM Taufiqur Rahman 0 票
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如果您可以直接与我们联系并提供您的计算机规格和您尝试导入的文件的详细信息,那么最好。 

希拉里·米勒(Hilary Miller) 0 票
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