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CSV 作为插件导入

我正在尝试使用 Wrapper Plugin Creator 为通过命令行运行的 python 程序制作插件。该程序将从 Geneious BLAST 共识结果文件中导出的 CSV 作为输入。根据您的一个帮助页面,包装器可以容纳一个程序,该程序“以 Geneious Prime 可以导出的格式将输入序列作为磁盘上的文件接受”。这会让我相信 CSV 可以用作输入类型,因为 Geneious 可以导出此类文件。但是,我唯一的选择是 .fasta.gz、.fasta、.fastq、.fastq.gz、.gb、.xml、.meg、.nex、.phy。我将文档类型选择为“多重对齐(4+ 序列)”,但我确实尝试选择其他选项,但似乎没有一个选项可以作为 CSV 格式使用。同样,我尝试了不同的序列类型选项无济于事。我将插件类型选择为“常规操作”,因为它的功能是获取 CSV 并以特定方式解析信息,创建以我们需要进一步分析的方式排序的新输出文件。如果您能就如何选择 CSV 作为输入格式提出建议,我将不胜感激!

1条评论

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首先,我为极慢的回复道歉!不知何故,我们直到现在都忽略了这个问题。

不幸的是,您在我们的代码中遇到了一个限制,它检测哪些导出器与包装器插件接受的文档类型兼容。我们已经在 Geneious Prime 的下一个主要版本 (2021.2) 中修复了这个问题。抱歉,在此期间我无法为您想到解决方法。

如果您有任何其他问题,请告诉我们,我们将努力在下次更及时地回答!

马特·基斯(Matt Kearse) 0 票
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