Genbank 特征位置跨度为零

Hello,

我们在genious 中生成的genbank 文件存在问题，该文件包含跨度为零的特征。

我们正在使用 biojava genbank 解析器，尝试读取一个通用的 genbank 文件时出现以下错误：

引起：java.lang.IllegalStateException：开始（11784）大于结束（4）；这是不正确的格式

我有几个关于这个的问题，希望你能帮助我：

Geneious 用于跨零特征的格式是否受 genbank 格式支持？因此是 biojava 解析器不正确。

或者是否未完全指定过零功能的格式，这意味着 Geneious 实现是有效的，但 biojava 不支持？

非常感谢，
詹姆士

詹姆斯·莫里斯 2021年3月1日16:33

官方评论

嗨，詹姆斯，

感谢您提请我们注意这一点。

据我所知，后者是这种情况：
没有一个令人满意的明确规范应该如何在 Genbank 文件中声明跨越原点的特征。
Geneious 使用的实现由一些程序（例如 SnapGene）支持，但其他一些程序（例如 biojava）似乎不支持它。

乔纳斯·库恩 2021年3月2日4:31