多序列 GenBank 文件中 Vector NTI 解析器的错误

Hello,

尝试打开包含多个序列的 GenBank 文件时出现错误。

该文件是通过从我们的 LIMS 数据库中选择不同的 GenBank 文件来动态创建的。

一些 GenBank 文件是在 Vector NTI 中创建的，当一个 Vector NTI 序列包含在组合的 GenBank 文件中时，我遇到了问题。

我创建了一个简单的示例（删除序列详细信息和注释），它仍然会产生我所看到的问题

LOCUS test_seq1 1 bp DNA 环状 SYN 15-JUN-2021
定义 -。
访问 -
关键词-。
来源 -。
生物
评论 此文件由 Vector NTI 创建
http://www.invitrogen.com/
 COMMENT ORIGDB|GenBank
评论 LSOWNER|
评论 VNTNAME|ABC1.1|
特点位置/预选赛
起源
1 克
//
 LOCUS test_seq2 1 bp DNA 环状 UNA 2021 年 6 月 15 日
定义
访问
版本
关键词。
来源
有机体。
起源
1吨
//
 LOCUS test_seq3 1 bp DNA 环状 UNA 15-JUN-2021
定义
访问
版本
关键词。
来源
有机体。
起源
1个
//

如果我尝试打开包含 3 个序列的上述 genbank 文件，则会加载第一个序列，然后出现上述错误。

如果包含的序列都没有 Vector NTI 注释，则不会出现错误；如果所有序列都具有 Vector NTI 注释，则不会出现错误。错误似乎只发生在不同来源的序列混合时。

如果我的理论是正确的，你会推荐什么来解决这个问题？

是从 Vector NTI 序列中删除注释还是向非 Vector NTI 序列添加注释，以便它们可以从同一文件加载？

非常感谢，

詹姆士

错误的技术细节如下

com.biomatters.geneious.publicapi.plugin.DocumentImportException
在 com.biomatters.iseek.plugin.fileimport.Da(ImportExceptionData.java:84)
在 com.biomatters.iseek.plugin.fileimport.Ea(Importage.java:266)
在 com.biomatters.iseek.plugin.fileimport.FileImporterManager.a(FileImporterManager.java:683)
在 com.biomatters.iseek.plugin.fileimport.FileImporterManager.a(FileImporterManager.java:650)
在 com.biomatters.iseek.plugin.fileimport.FileImporterManager.a(FileImporterManager.java:535)
在 com.biomatters.iseek.plugin.fileimport.FileImporterManager.a(FileImporterManager.java:388)
在 com.biomatters.iseek.plugin.fileimport.v.run(FileImporterManager.java:309)
在 java.base/java.lang.Thread.run(Thread.java:834)
引起：com.biomatters.geneious.publicapi.plugin.DocumentImportException：已到达作者信息中的文件末尾
在 com.biomatters.iseek.plugin.fileimport.DocumentAggregatingImportCallback.a(DocumentAggregatingImportCallback.java:415)
在 com.biomatters.iseek.plugin.fileimport.Ea(Importage.java:149)
 ...6 更多
引起：com.biomatters.geneious.publicapi.plugin.DocumentImportException：已到达作者信息中的文件末尾
在 com.biomatters.plugins.fileimportexport.vectorntiimporter.sequenceImporter.aa(AuthorParser.java:119)
在 com.biomatters.plugins.fileimportexport.vectorntiimporter.sequenceImporter.aa(AuthorParser.java:102)
在 com.biomatters.plugins.fileimportexport.vectorntiimporter.sequenceImporter.e.(VectorNtiCommentsParser.java:59)
在 com.biomatters.plugins.fileimportexport.vectorntiimporter.sequenceImporter.VectorNtiSequenceImporter.importDocuments(VectorNtiSequenceImporter.java:80)
在 com.biomatters.geneious.publicapi.plugin.DocumentFileImporter.importDocuments(DocumentFileImporter.java:311)
在 com.biomatters.iseek.plugin.fileimport.DocumentAggregatingImportCallback.a(DocumentAggregatingImportCallback.java:404)
 ...还有 7 个