如何在我的质粒上注释启动子，抗生素抗性位点和其他特征？

在 Geneious 6.0 及更高版本中，您可以使用常见的启动子、终止子、克隆位点、限制性位点、报告基因、亲和标签、可选择标记基因、复制起点和开放阅读框自动注释质粒。  要注释您的质粒，请选择Annotate and Predict → Annotate From Database... 。在 Geneious Prime 2020.0 及更早版本中，这将使用PlasMapper使用的数据库中找到的特征来注释质粒。

Geneious Prime 2020.1 将Sample Documents/Plasmapper features文件夹替换为一个名为 Geneious Plasmid Features的新锁定参考功能数据库。该数据库包含常见质粒特征的扩展和修订列表，现在是Annotate from database工具的默认数据库。  Geneious Plasmid Features 数据库的内容可以在 Sources 面板中的Reference Features下查看。 

要注释您的质粒，请确保在从数据库注释设置中将参考特征或基因质粒特征设置为来源。  

更改相似度以设置传输注释的最小百分比标识。插入和删除计为不匹配，而模糊匹配计为部分不匹配（例如，N 对 A 为 0.75 的不匹配）。相似度是沿着注释的全长计算的，所以如果只有一半的序列覆盖了注释，那么相似度将为 50%。

要将注释传输到您的序列，请选择应用，然后选择保存以将这些更改保存到您的文档中。在您执行此操作之前，注释不会永久应用于您的序列，并且会出现褪色 - 如上面的屏幕截图所示。

高级...按钮还提供了一系列高级设置，您可以选择这些设置来更改序列的注释方式。

有关使用从数据库注释工具的更多信息，包括如何使用您自己的自定义序列作为注释数据库，请参阅从自定义注释数据库注释您的序列。